SDの遺伝学
(これまでの状況)

脂漏性皮膚炎に関係する候補遺伝子やゲノムの領域については、対象集団を集めることが出来ずに調べられることはなかった。

 

(今回明らかになったこと)

候補遺伝子アプローチ(CGA)を使用して、脂漏性皮膚炎とAD(アトピー性皮膚炎)または、PSO(乾癬)の間に共通の遺伝的背景があるという確固たる証拠は見つかりませんでした。

ただし、遺伝的感受性がおそらく脂漏性皮膚炎に役割を果たすことを示すパイロットGWAS(ゲノムワイド関連研究)で、脂漏性皮膚炎の2つのゲノム全体で有意な関連が確認されました。

 

本記事を読むと、脂漏性皮膚炎SDの遺伝学についてADとPSOの関連で、大まかに知ることができます。

 

紹介する論文
タイトル

脂漏性皮膚炎の遺伝学:候補遺伝子アプローチとパイロットゲノムワイド関連研究

掲載誌
J Invest Dermatol. 2018 4月; 138(4):991-993。

著者
Martijn GHサンダース 1、 ルバMパルド 1、 AndreG Uitterlinden 2、 エイドリアンMスミス 3、 レベッカSジンジャー 3、 Tamar Nijsten 4

所属
1エラスムス医療センター皮膚科、ロッテルダム、オランダ。
2エラスムス医療センター内科、エラスムス医療センター疫学部、ロッテルダム、オランダ。
3ユニリーバ研究開発、コルワースサイエンスパーク、シャーンブルック、英国。
4エラスムス医療センター皮膚科、ロッテルダム、オランダ。電子アドレス:t.nijsten@erasmusmc.nl。

概要
To editor
脂漏性皮膚炎は、病因が複雑な慢??性炎症性皮膚疾患です。脂漏性皮膚炎の遺伝的素因は研究されていないため、この状態の病因に関与する候補遺伝子は存在しません。しかし、脂漏性皮膚炎は、他の慢性炎症性皮膚疾患、特に乾癬(PSO)(時に造血性乾癬症)およびアトピー性皮膚炎(AD)といくつかの臨床的特徴を共有しており、遺伝的にはるかに特徴的です(パターノスター他、2015、 Tsoi et al。、2017)。
この横断的研究では、候補遺伝子アプローチ(CGA)を使用して、以前にADおよびPSOに関連していた遺伝的変異が脂漏性皮膚炎のリスク増加とも関連しているかどうかを調査しました。さらに、脂漏性皮膚炎に関連する遺伝的変異を特定するために、ゲノムワイド関連研究(GWAS)を実施しました。
メソッドの詳細な説明は、オンラインの補足資料にあります。手短に言えば、主要なコホート(RS-I)と2つの拡張(RS-IIおよびRS-III)で構成される慢性疾患の進行中の前向きコホート研究であるロッテルダム研究(RS)の参加者を含めました。RSは、エラスムス医療センターの医療倫理委員会およびオランダの厚生スポーツ省から承認されています。すべての参加者は、研究に参加し、担当医師から情報を入手するための書面によるインフォームドコンセントを提供しました(Ikram et al。、2017)。脂漏性皮膚炎は、医師による全身の皮膚検査中に診断されました。全血からのDNA抽出、ジェノタイピング、帰属、および品質管理は、標準的なプロトコルに従って実行されました。品質管理後、9,008,729のマーカーが含まれていました。
CGAは2つのステップで実行されました。最初に、以前に関連付けられたPSOおよびAD SNPの単一ヌクレオチド多型(SNP)ベースのCGAが、加齢、性別、および遺伝的分散の4つの主要コンポーネントに対して調整された加法モデルを用いたロジスティック回帰を使用して実行されました。これらの最後の共変量は、可能な人口の層別化と隠れた関連性を説明するために使用されました(詳細については、補足資料を参照してください)。第二に、遺伝子ベースのCGAは、以下のアプローチを使用して関心領域内の追加のバリアントをスクリーニングするためにパーセル等。(2007)(詳細については、補足資料を参照してください)。脂漏性皮膚炎の新しい遺伝子座を発見するために、SNPベースのアプローチと同じモデルを使用して、コホートごとにGWASを実施しました。3つの別々のコホートのGWASは、ProbABELパッケージ(Aulchenko et al。、2010)、メタ分析は金属(ウィラー他、2010)(補足資料を参照)。
合計で4,050人の参加者が分析に利用でき、そのうち609人(15%)が脂漏性皮膚炎を患っていました(オンラインの補足表S1を参照)。SNPベースおよび遺伝子ベースのCGAは、複数のテストを修正した後、脂漏性皮膚炎の有意な遺伝子座を生成しませんでした(補足表 S2?S5をオンラインで参照)。一部の所見では、脂漏性皮膚炎とPSOおよびADの重複が示唆されました。たとえば、PSOとADで役割を果たすことが知られているLCE3遺伝子クラスターは、SNPベースのCGAと遺伝子ベースのCGAの両方のデータで脂漏性皮膚炎との示唆的な関連を示しました(それぞれP = 0.0157およびP = 0.00869) )。MICB遺伝子ベースのCGA(P = 0.0063)で示唆的な証拠を示し、IL12BはSNPベースのCGA(P = 0.02011)で示唆的な証拠を示した(表1)。

文献検索キーワード:Seborrheic dermatitis medicine

まとめ~SDの遺伝学について、ADとPSOとの関連性を調べた

(今回明らかになったこと)

・脂漏性皮膚炎は、AD(アトピー性皮膚炎)やPSO(乾癬)の間に共通の遺伝的背景があるという証拠は見つかりませんでした。

・ただし、遺伝的感受性がおそらく脂漏性皮膚炎に役割を果たすことを示すパイロットGWAS(ゲノムワイド関連研究)で、脂漏性皮膚炎の2つのゲノム全体で有意な関連が確認されました。。

 

研究の詳細

慢性疾患の進行中の前向きコホート研究であるロッテルダム研究(RS)の参加者

合計で4,050人の参加者が分析に利用でき、そのうち609人(15%)が脂漏性皮膚炎を患っていました(オンラインの補足表S1を参照)。SNPベースおよび遺伝子ベースのCGAは、複数のテストを修正した後、脂漏性皮膚炎の有意な遺伝子座を生成しませんでした

一部の所見では、脂漏性皮膚炎とPSOおよびADの重複が示唆されました。

(例)
PSOとADで役割を果たすことが知られているLCE3遺伝子クラスターは、SNPベースのCGAと遺伝子ベースのCGAの両方のデータで脂漏性皮膚炎との示唆的な関連を示した(それぞれP = 0.0157およびP = 0.00869) )。
MICB遺伝子ベースのCGA(P = 0.0063)で示唆的な証拠を示し、IL12BはSNPベースのCGA(P = 0.02011)で示唆的な証拠を示した(下のテーブル1)。

SDとSNP

テーブル2.GWAS(ゲノムワイド関連研究)についてのSNPs解析結果

SDとGWAS

 

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